腸道又被稱為「第二大腦」，在胚胎時期，腸道和大腦兩者是同時發展的。腸道掌管人體無比重要的消化功能，擁有一套獨立自主的「腸道神經系統」（ENS, enteric nervous system）。
臨床、流行病學和免疫學證據表明，腸道微生物群廣泛且深刻地影響腸腦關係，包括精神狀態、情緒調節、神經肌肉功能和內分泌調節等。許多研究已經證實微生物群對大腦情緒和認知中心的影響，某些情緒障礙如焦慮、憂鬱和自閉症，已明確與胃腸道功能紊亂有關，而飲食也被證明會影響腸道微生物群對認知功能的影響。
1️⃣迷走神經與神經系統
神經元，是組成神經系統結構和執行神經功能活動的一類高度分化細胞，存在於大腦和中樞神經系統中，它們會告訴你的身體該如何行動。人腦中大約有1000億個神經元，而腸道中有5億個神經元，這些神經元通過神經系統中的神經與大腦相連；迷走神經是連接腸道與大腦的最大神經之一，能夠雙向傳遞信號。
在動物研究中發現，壓力會抑制迷走神經傳遞的信號，同時也會引發腸胃問題；一項針對人類的研究發現，患有腸躁症（IBS）或克羅恩病的人，其迷走神經的功能較弱；另一項針對小鼠的有趣研究發現，給予小鼠益生菌可降低其血液中的壓力荷爾蒙水平，但當切斷迷走神經後，益生菌的效果消失了。這表明迷走神經在腸腦軸及其在壓力中的角色中至關重要。
2️⃣神經傳遞物質
腸道與大腦也透過稱為神經傳遞物質的化學物質相連，大腦中產生的神經傳遞物質控制情緒和感覺。例如，血清素有助於提升快樂感並協助調節生物鐘，有趣的是，這些血清素也由腸道細胞和居住於腸道的數億個微生物產生。
此外，腸道微生物也會產生一種稱為γ-氨基丁酸（GABA）的神經傳遞物質，有助於控制恐懼和焦慮的感覺。小鼠的研究顯示，某些益生菌能夠增加GABA的生成並減少焦慮和類似憂鬱的行為。
3️⃣腸道微生物製造其他影響大腦的化學物質
居住於腸道微生物還會製造其他影響大腦運作的化學物質，透過消化纖維產生大量的短鏈脂肪酸（SCFA），如丁酸、丙酸和乙酸，能以多種方式影響大腦功能，例如減少食慾。
一項研究發現，食用丙酸能減少食物攝取量並降低與高能量食物獎勵相關的大腦活動；丁酸對於血腦屏障也很重要，另外腸道微生物還會代謝膽汁酸和氨基酸，產生能影響大腦的化學物質，兩項小鼠研究發現，壓力和社交障礙會減少腸道細菌產生的膽汁酸，並改變與其生成相關的基因。
4️⃣發炎反應
腸腦軸也透過免疫系統相連，腸道和腸道微生物在免疫系統及發炎反應中扮演重要角色，控制哪些物質進入體內，而哪些物質須被排出體外，如果免疫系統長時間處於活化狀態，可能會導致發炎反應的產生，並與許多大腦疾病如抑鬱症和阿爾茨海默氏症有關。
照顧好腸道菌叢的健康，維持腸道微生態的平衡，是維持良好情緒的關鍵，有幾類食物對腸腦軸特別有益：
•Omega-3：Omega-3廣泛存在於脂肪含量高的魚類當中，如鯖魚，研究顯示，Omega-3能增加腸道中的益菌，並降低大腦疾病的風險。
•發酵食品：優格、酸菜和起司等都含有乳酸菌等健康微生物，已被證明能改變大腦活動。
•高纖維食品：全穀物、堅果、水果和蔬菜都含有對腸道細菌有益的益生元（Prebiotics）纖維，能降低人體內的壓力荷爾蒙。
•富含多酚的食物：可可、綠茶、橄欖油和咖啡等含有多酚，健康的腸道細菌，並可能改善認知能力。
•富含色氨酸的食物：色氨酸是一種可轉化為神經傳遞物質血清素氨基酸。富含色氨酸的食物包括火雞、雞蛋和起司。
古希臘的醫學之父希波克拉底曾說過:「所有疾病都是始自於腸道（All diseases begin in the gut.）」 所以保持腸道健康，大腦會健康，人才會健康，照顧好腸道微生物，腸道微生物就會照顧好你~
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